Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Chd1P40201 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Chd1P40201 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Chd1P40201 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Chd1P40201 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chd1P40201 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chd1P40201 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
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