Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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