Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RxraP28700 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RxraP28700 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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