Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms