Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
P10404 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
P10404 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms