Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TtrP07309 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TtrP07309 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TtrP07309 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TtrP07309 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TtrP07309 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TtrP07309 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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TtrP07309 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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TtrP07309 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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