Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccl20O89093 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms