Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms