Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms