Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms