Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PtprbB2RU80 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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