Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms