Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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