Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms