Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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