Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prpf39Q8K2Z2 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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