Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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