Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms