Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cldn17Q8BXA6 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cldn17Q8BXA6 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Cldn17Q8BXA6 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Cldn17Q8BXA6 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Cldn17Q8BXA6 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cldn17Q8BXA6 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms