Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube2q1Q7TSS2 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms