Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms