Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CtifQ6PEE2 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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