Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PcolceQ61398 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms