Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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