Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms