Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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