Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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