Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gjb1P28230 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gjb1P28230 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms