Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RhoP15409 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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