Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ptpn9O35239 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
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Ptpn9O35239 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms