Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp9yF8VPU6 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms