Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms