Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms