Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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