Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Cnot2-202ENSMUST00000105265 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Tyms-201ENSMUST00000026846 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gpbp1-201ENSMUST00000047627 3694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 BC026762-201ENSMUST00000206555 2503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bcl11bQ99PV8 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms