Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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