Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms