Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms