Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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