Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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