Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Clcn1Q64347 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms