Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm16223-201ENSMUST00000087332 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Olfr954-202ENSMUST00000214818 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Zfp189-201ENSMUST00000042964 2835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Pnisr-203ENSMUST00000108229 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Cflar-201ENSMUST00000069333 3163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Lpin3-202ENSMUST00000109455 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Pou2f1-216ENSMUST00000184643 2201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Btnl10-203ENSMUST00000108818 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 1700030O20Rik-201ENSMUST00000185546 594 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Btnl10-201ENSMUST00000020792 1028 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm5173-201ENSMUST00000219616 950 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm8153-201ENSMUST00000219844 952 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm44317-201ENSMUST00000204314 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Ublcp1-201ENSMUST00000102795 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Cnr2-201ENSMUST00000068830 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 R3hdm1-208ENSMUST00000187900 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Zfp940-201ENSMUST00000085792 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm38383-201ENSMUST00000194131 2660 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Zfp260-201ENSMUST00000050735 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Bcas1-201ENSMUST00000013667 2916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Dlg2-202ENSMUST00000098308 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm11440-201ENSMUST00000121509 527 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r2-ps7-202ENSMUST00000185057 763 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms