Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254 ms