Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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