Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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Rpusd3Q14AI6 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rpusd3Q14AI6 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms