Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Traf3ip1Q149C2 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms