Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms