Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gja5Q01231 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gja5Q01231 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms