Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Irx1P81068 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Irx1P81068 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms