Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VdrP48281 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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